菌類を代表する大きなグループとして，子嚢菌類，担子菌類，接合菌類があります．その他に種数は少ないですが，ケカビの仲間と，ツボカビの仲間があり，これで全てです．

その他にも，かつては菌類の仲間として位置付けられ，今は別の仲間に位置付けられているものがあります．変形菌類，卵菌類，サカゲツボカビ，ラビリンチュラです．変形菌類は，アメーバと一緒にされアメーボゾアというグループに，卵菌類・サカゲツボカビ・ラビリンチュラは，藻類の褐藻・珪藻と一緒にストラメノパイルというグループに移動したのです．

残った仲間のうち，高等とされる菌類が，子嚢菌類と担子菌類です．シイタケやナメコなどスーパーで売っているきのこのほとんど全ては担子菌類で，一般にきのこと認識されているのが担子菌類です．

子嚢菌類はと言うと，きのこの中では例外的なアミガサタケの仲間がありますが，あまり目にする子嚢菌類というのはありません．となると，認識されているかどうかは別にして，目にしやすい子嚢菌類と言えば，ずばり地衣類と言っても過言ではないでしょう．

さて，この子嚢菌類と担子菌類ですが，決定的な違いは，胞子のでき方です．子嚢菌類が作るのは子嚢胞子，担子菌類では担子胞子です．