地衣類において化学分類学的な手法として，最初に考案されたのが「呈色反応」，次いで「顕微結晶法」，更に「薄層クロマトグラフィー（TLC）」です．これらは高価な機器を必要とせず，比較的単純な装置だけで実施できるため，今でも同定の現場で幅広く利用されています．ここでは，この3つの方法について紹介します．

一方，特別な機器を使うことで，詳細な分析が可能となっています．それらについては「４．地衣成分の分析」をご覧ください．

＜概要＞地衣類に含まれる地衣成分を分類上の特徴として利用する歴史は古くからあります．これに最初に気づいたのはフィンランドの地衣学者，ニュランダー（Nylander）です．彼が1867年に発表した論文（文献１）の中で，さらし粉の水溶液か，水酸化カリウムの水溶液を地衣類に付けると，赤くなる種類とならない種類があり，この方法が分類に使えると発表したのです．この方法は，現在は呈色反応と呼ばれるもので，さらし粉の水溶液はC液，その反応はC反応と呼ばれ，水酸化カリウム水溶液はK液，反応はK反応といいます．
この他にもいくつかの呈色反応がありますが，中でも主要なP液・P反応を考案したのは朝比奈泰彦でした（文献２）．

＜概要＞有機化学・薬学の分野において地衣成分を調べようという動きはニュランダーと同じ頃，ドイツのツォップ（Zopf）により本格的に始められました．これによって多くの地衣成分が知られるところとなりましたが，分析には地衣類を何キログラムも使う必要がありました．

　それをごく少量の地衣類から成分を抽出し，スライドグラス上で簡単に結晶を作り（プレパラートにして），顕微鏡下で観察し，その形状から成分を同定する，顕微結晶法が1920年代から朝比奈によって精力的に進められ，集大成されました（文献１）．彼は薬学者でしたが，その知識を生かし，地衣類の分類への応用を図ったのです．結晶を作るための試薬を何種類か考案し，呈色反応の結果と合わせて，数十種類の地衣成分を同定することができるようになりました．

＜概要＞20世紀の半ばを過ぎたころの有機化学における分析技術の進歩が，地衣類の化学分類にも新しい手法をもたらしました．1970年代前後に，アメリカのカルバーソン（C.F. Culberson）等は，薄層（はくそう）クロマトグラフィーを，地衣成分の分析方法として標準化したのです．

ガラスやアルミの板の片面に，シリカゲルの粉の層が貼り付いている薄層プレートを使用します．アセトンなどで地衣類から抽出したエキスを，プレートの下のほうにスポットしておきます．ガラスでできた展開槽に展開溶媒（ここでは複数の有機溶媒を一定の割合で混ぜたもの）を少量入れ，そこにプレートを設置し蓋をし，静置します．すると溶媒がゆっくりとシリカゲル層を上っていきます．このとき，スポットに含まれていた地衣成分が，溶媒とともに上っていく速度が，地衣成分ごとに異なります．ある成分は溶媒が到達した線近くまで移動するかと思えば，ほとんど移動しない成分もあります．同じ成分でも，溶媒の種類によって速度が異なります．